一、按工业用途分：压电水晶、光学水晶、熔炼水晶，主要从裂隙、包裹体、节瘤、双晶等方面进行区分。 
二、按颜色、形态和物理性质差异可分为: 
(1)水晶：无色、透明如水的晶体; 
(2)紫晶：呈紫色透明或半透明（含三价铁和锰）； 
(3)烟水晶(俗称为茶晶)，呈烟黄色或烟褐色的透明晶体; 
(4)墨晶：墨黑色，含有机质的半透明晶体; 
(5)黄晶：呈黄色到红-桔黄-褐色的透明晶体(含二价铁); 
(6)蔷薇水晶（又称“芙蓉石”）：呈蔷薇色，浅玫瑰色的至密块状体(含Ti等微量元素)； 
(7)发晶：含金刚石、角闪石等毛发状矿物包裹体者; 
(8)绿水晶：含阳起石针状包裹物; 
(9)彩虹水晶：含有细小气泡或淬体充填裂隙的水晶，这些裂隙通过干涉光产生彩虹。